Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CNGB1Q14028 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms