Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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CKAP5Q14008 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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CKAP5Q14008 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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CKAP5Q14008 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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CKAP5Q14008 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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CKAP5Q14008 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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CKAP5Q14008 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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CKAP5Q14008 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CKAP5Q14008 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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