Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
C1DQ13901 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
C1DQ13901 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
C1DQ13901 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
C1DQ13901 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.5 ms