Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PKP1Q13835 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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