Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
APOFQ13790 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
APOFQ13790 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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APOFQ13790 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
APOFQ13790 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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