Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FHL3Q13643 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FHL3Q13643 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms