Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDH18Q13634 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDH18Q13634 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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