Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CUL3Q13618 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CUL3Q13618 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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