Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
ATRQ13535 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATRQ13535 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
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