Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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TUBB3Q13509 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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TUBB3Q13509 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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TUBB3Q13509 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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TUBB3Q13509 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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TUBB3Q13509 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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TUBB3Q13509 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
TUBB3Q13509 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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