Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TCIRG1Q13488 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TCIRG1Q13488 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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