Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
LSAMPQ13449 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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