Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TCOF1Q13428 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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