Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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