Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NME3Q13232 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NME3Q13232 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NME3Q13232 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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