Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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ERCC8Q13216 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ERCC8Q13216 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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