Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CHAF1AQ13111 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CHAF1AQ13111 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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