Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRDNQ13061 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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