Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
IFFO1Q0D2I5 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
IFFO1Q0D2I5 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms