Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHRNEQ04844 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHRNEQ04844 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms