Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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PGGT1BP53609 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
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PGGT1BP53609 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PGGT1BP53609 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PGGT1BP53609 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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PGGT1BP53609 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PGGT1BP53609 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PGGT1BP53609 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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