Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD12P35452 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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