Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
NISCHQ9Y2I1 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NISCHQ9Y2I1 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms