Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
FOXQ1Q9C009 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms