Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
MEIS3Q99687 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MEIS3Q99687 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms