Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SAMD8Q96LT4 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SAMD8Q96LT4 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms