Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TNIP3Q96KP6 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TNIP3Q96KP6 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms