Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC47Q96A33 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC47Q96A33 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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