Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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CHCHD4Q8N4Q1 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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CHCHD4Q8N4Q1 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHCHD4Q8N4Q1 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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