Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NLRC3Q7RTR2 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NLRC3Q7RTR2 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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