Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
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UBR3Q6ZT12 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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UBR3Q6ZT12 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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UBR3Q6ZT12 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
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UBR3Q6ZT12 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
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UBR3Q6ZT12 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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UBR3Q6ZT12 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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UBR3Q6ZT12 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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UBR3Q6ZT12 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
UBR3Q6ZT12 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
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