Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ANKRD39Q53RE8 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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