Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TPRNQ4KMQ1 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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