Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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RTL8BQ17RB0 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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RTL8BQ17RB0 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
RTL8BQ17RB0 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
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