Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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