Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN9AQ15858 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN9AQ15858 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
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