Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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ALX1Q15699 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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ALX1Q15699 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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ALX1Q15699 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ALX1Q15699 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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