Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SYCP1Q15431 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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