Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BRD3Q15059 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BRD3Q15059 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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BRD3Q15059 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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BRD3Q15059 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
BRD3Q15059 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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