Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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SNX17Q15036 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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SNX17Q15036 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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SNX17Q15036 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX17Q15036 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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