Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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SMCO1Q147U7 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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SMCO1Q147U7 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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SMCO1Q147U7 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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SMCO1Q147U7 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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SMCO1Q147U7 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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SMCO1Q147U7 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMCO1Q147U7 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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SMCO1Q147U7 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SMCO1Q147U7 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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