Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SSPNQ14714 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SSPNQ14714 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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