Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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