Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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CUL4AQ13619 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL4AQ13619 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL4AQ13619 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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