Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HDAC1Q13547 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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