Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATRQ13535 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATRQ13535 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATRQ13535 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms