Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
KLF1Q13351 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF1Q13351 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF1Q13351 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF1Q13351 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF1Q13351 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF1Q13351 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF1Q13351 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF1Q13351 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KLF1Q13351 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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