Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SP140Q13342 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SP140Q13342 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SP140Q13342 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SP140Q13342 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SP140Q13342 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SP140Q13342 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SP140Q13342 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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SP140Q13342 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SP140Q13342 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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