Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SEMA3FQ13275 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SEMA3FQ13275 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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