Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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ERCC8Q13216 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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ERCC8Q13216 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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ERCC8Q13216 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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ERCC8Q13216 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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ERCC8Q13216 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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ERCC8Q13216 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ERCC8Q13216 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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